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[问答题简答题] 如何选择合适的评分矩阵？

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[问答题简答题] 如何选择合适的评分矩阵？

参考答案:

一般来说，在局部相似性搜索上，BLOSUM矩阵较PAM要好当比较距离相近的蛋白时，应选择低的PAM或高的BLOSUM矩阵；当比较距离较远的蛋白时，应选择高的PAM或低的BLOSUM矩阵对于数据库搜索来说一般选择BLOSUM62矩阵PAM矩阵可用于寻找蛋白质的进化起源，BLOSUM矩阵用于发现蛋白质的保守域

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