电子肛门镜用于帮助诊断肛门和直肠疾病，检测精准，包括内外痔、混合痔、肛裂、直肠息肉等多种肛肠疾病。而肠镜的操作有点复杂，其是从肛门插入，将肠镜循腔插入至回盲部，从黏膜侧观察结肠病变的检查方法，是发现肠道肿瘤及癌前病变最简单、最安全、最有效的方法。
一、电子肛门镜和肠镜区别在哪里
1、检查的部位不同。肠镜检查除小肠外的全部肠道组织，可以发现包括直肠发生在内的大部分肠道病变，而肛门镜只是用来检查位于肛门上端的直肠组织，只可以发现直肠出现的一些如慢性溃疡性直肠炎、直肠肿瘤等病变。
2、检查时间的长短不同。肠镜需要检查大部分的肠道组织，需要的时间也比较长，如果部分患者在检查过程中发现可疑的状况，还需要进行活检，检查时间同样也会延长。而电子肛门镜检查时多数在10分钟左右就可完成检查。
二、如何选择做电子肛门镜还是肠镜
电子肛门镜和肠镜在肛肠科都是检查设备，但在检查时只会用其中一种，虽然这两种设备都能检查出炎症、溃疡和肿瘤，但其两种检查手段各有所长，患者究竟要选择哪一种，是要依据病情所需进行选择，可以参考专业医生的意见。