肾积水的治疗以尽快解除尿路梗阻为原则，根据具体的病因及病情，采取不同的治疗方法，如外科手术解除梗阻、微创介入引流尿液,甚至切除肾脏等。
1、外科手术解除梗阻：查明梗阻原因后，通过手术解除梗阻的相关因素，如先天性肾盂输尿管狭窄可行离断成形术，尿路结石可行内镜引导下碎石取石术等。
2、微创介入引流尿液：患者不耐受大手术、梗阻相关因素暂时无法去除时，可在超声引导下经皮肾穿刺造瘘，引流尿液；对于晚期肿瘤压迫或输尿管难以修复的狭窄引起肾积水的患者，也可经膀胱镜放置双J管，长期引流尿液。
3、肾脏切除：重度肾积水等肾功能严重丧失的情况下，若对侧肾功能正常，可选择通过手术切除肾积水一侧的肾。