男性大便憋不住的原因与肛门内、外括约肌的机制有关，部分男性憋不住大便还可能与疾病有关。
人体的肛门内括约肌不受大脑意识控制，在需要大便时在直肠释放信号刺激后就开始舒张排便；肛门外括约肌受大脑意识约束，收缩时可憋住大便，但容易因疲劳而无法持续收缩。情况不允许排便时，内、外括约肌处于互相竞争的状态，外括约肌容易疲劳，内括约肌最终舒张，大便就憋不住了。
此外，肛管直肠炎、急性胃肠炎、肛窦炎、肠炎等消化道疾病可能会直接导致大便失禁，或引起括约肌功能障碍，继而导致大便憋不住。总的来说，无论男女，都不建议憋大便，有便意时应及时排便。