瞳孔反射消失的临床意义有，一，颅脑受到严重的外伤后，中脑功能会完全受损，瞳孔对光的反射就完全消失。二，严重中毒，其毒素损伤神经平面位置高于中脑神经中枢时，就会存在瞳孔对光反射消失的现象。三，自发性的脑出血如脑干出血，或者外伤造成的脑出血，压迫延髓和中脑，就会存在对光反射消失。
四，高度神经功能损伤。五，深度昏迷的患者就会存在瞳孔对光的反射消失。六，麻醉平面过深，也会出现对光反射消失。七、是神经疾病，包括严重的视神经炎等，可能造成瞳孔反射消失。
观察瞳孔的变化，有助于对颅脑损伤或者视神经疾病患者的病情判定。