医学上所说的蓝白斑筛选，是基因工程中比较常用的一种细菌重组子的筛选方式。一般在通过人工接入外部基因后，突变了的大肠杆菌的β半乳糖苷酶基因会被插入的外源基因切断，导致不能转化成完整的β半乳糖苷酶，所以无法对X~gal进行再次切割，故菌落显现为白色。
一、蓝白斑筛选的注意事项：
1、实际操作中发现当插入小片段时，重组子也有形成浅蓝斑的情况.即蓝色菌斑也有可能含外源基因；
2、大概有30%的假阴性. 若形成的白斑很多，但仍不是阳性克隆，需仔细检查你的质粒载体和目的片段连接转化时间温度控制好 避免载体自连并且排除你的酶切插入位点等没有出现设计问题；
3、若用T载体连接，有时会出现蓝白斑，但有时出现全是白斑。
二、蓝白斑筛选的原因：
1、X~gal涂得不够或IPTG加得不够。
2、显色的时间可能不够，延长时间或放入低温冰箱可加强显色。
3、连接产物里面空载的载体本来就极少，这可能是主要原因。