神经外科学从治疗的疾病谱上主要包括为功能性脑病、脑血管病、脑肿瘤。通常是采用手术的方法来进行修正神经系统功能的异常的医学分支称作功能神经外科学，也叫做应用神经生理学或生理神经外科学。功能神经外科主要是治疗由于外伤所导致的患者其他部位或脑部出现了神经系统的疾病、功能紊乱的疾病部分遗传代谢的障碍，神经外科的疾病的种类比较多，例如功能性的疾病、脊柱的病变、颅脑的损伤、颅骨的肿瘤、脑血管的疾病等都可以在神经外科进行治疗。
功能神经外科的病症分类
1、运动障碍病
曾经也叫做锥体外系的疾病，主要是由于基底节区病变所导致的以运动功能紊乱为主要的临床特征的疾病群。其中帕金森病就是最为典型的代表。此外，还包括抽动秽语综合征、舞蹈症、肌张力障碍、原发性震颤等。
2、癫痫病
发作时的状态是癫痫病的最主要的临床特征，癫痫病发作的时候常常表现为广泛的影响植物神经、感觉、运动、精神等，发作的间期可以完全是正常的状态。根据致痫灶解剖的位置不同可以划分为部分癫痫综合征、顶枕叶癫痫、额叶癫痫、颞叶癫痫等。