轻度先天性巨结肠的疾病可以通过适当的治疗方法来治愈，但严重的患者想要治愈会有一定的困难，具体需要从患者的实际情况和后期的恢复等方面进行。先天性巨结肠的治疗一般为手术治疗，手术治疗包括过渡性手术和确定性手术，对于体质负担不起大手术的患者，在治疗改善好转后才能进行根治性手术，同时注意预防术后便秘，出现便秘会影响病情恢复。
先天性巨结肠症状
1、先天性巨结肠病的症状因病肠长度不同而有不同的临床表现，大多在婴儿出生后48小时内不排出或减少排除少量胎便，可在2~3天出现低位部分，甚至完全肠梗阻症状，呕吐、腹胀不排便。痉挛段不太长的患儿，经直肠指检或是温盐水灌肠后，可排出大量胎儿大便和气体症状缓解，但痉挛段太长的患者，梗阻症状多的不会缓解，严重时需要手术治疗。
2、长期腹胀，便秘可使患者食欲下降，影响营养物质的吸收，腹部可出现宽肠，有时可出结，充满粪便的石和肠袢，检查直肠指时有大量气体会跟随手指拔排出体外，巨结肠病会伴随着小肠结肠炎疾病的出现，尤其是在新生儿期，患儿会出现全身腹胀、剧烈呕吐，有时还会出现腹泻。由于腹泻和肠管扩张有大量肠液堆积，会出现脱水，酸中毒，高热等并发症，如果不及时治疗，则会出现较高的死亡率。