更年期屁股疼可能是更年期肛门神经官能症、雌激素缺乏或腰椎间盘突出症等疾病导致的，
1、更年期肛门神经官能症：此病主要是患者因更年期精神紧张、焦虑等，感觉肛门部位有里急后重、疼痛、瘙痒等不适，也就表现为屁股疼。患者大多数无器质性病变，主要是神经精神因素导致的感觉异常。
2、雌激素缺乏：患者更年期卵巢功能衰退，导致患者雌激素分泌减少，如果补充不足，可能会导致患者刺激素缺乏，继而可能出现阴道萎缩、反复泌尿系感染以及骨质疏松、血管硬化等疾病，导致患者精神紧张、容易骨折，感到腰部、屁股疼等不适。
3、腰椎间盘突出症：患者长时间弯腰劳动、久坐、妊娠等，导致腰椎长时间受压、腰肌劳损，患者更年期雌激素缺乏、骨质疏松，容易造成腰椎间盘突出，压迫神经导致患者感到腰部、屁股疼。
除上述原因外，痔疮、梨状肌综合征、坐骨结节滑膜炎等疾病也会导致患者感到臀部疼痛，需要就医检查鉴别。