乳腺纤维腺瘤的乳房肿块应与其他同样以乳房肿块为主要临床表现的疾病相鉴别，如乳腺增生病、乳腺囊肿及乳腺癌。
（1）乳腺纤维腺瘤与乳腺增生病：两者均可见到乳房肿块，单发或多发，质地韧实。但乳腺纤维腺瘤的肿块以单侧单发者较为多见，多呈圆形或卵圆形，边界清楚，活动度大，肿块无痛感及触痛，与月经周期无明显关系，发病年龄以30岁以下者多见；乳腺增生病的肿块以双侧多发者较为常见，可呈结节状、片块状或颗粒状，质地较软或硬韧，肿块常有明显痛感及触痛，且可随月经周期而发生变化，月经前整个乳房常有胀感，经后可缓解，发病年龄以30岁以上者多见。必要时可行有关辅助检查予以鉴别，如乳房钼靶X线摄片，乳腺纤维腺瘤常可见到圆形或卵圆形密度均匀的阴影，其周围可见有一圈环行的透明晕，据此可与乳腺增生病相鉴别。
（2）乳腺纤维腺瘤与乳腺囊肿：两者均可见到无痛性的乳房肿块，多为单侧单发，边界清楚，表面光滑。但乳腺纤维腺瘤的肿块质地较囊肿稍硬韧，无囊性感，活动度较囊肿为大，且发病年龄以18～25岁最为多见；乳腺积乳囊肿的肿块有囊性感，活动度不似腺瘤那样大，且多发于妊娠哺乳期，乳腺单纯囊肿则除囊肿外尚有乳腺增生病的临床特征。此外，可行肿块穿刺予以鉴别，腺瘤为实性肿块，无液体；而囊肿则可抽出乳汁样或浆液性的液体。
（3）乳腺纤维腺瘤与乳腺癌：两者均可见到无痛性乳房肿块，多为单发。乳腺纤维腺瘤的乳房肿块呈圆形或卵圆形，质地韧实，表面光滑，边界清楚，活动度大，肿块生长缓慢，一般以1～3cm大者较常见，超过5cm者少见，同侧腋窝淋巴结无肿大，发病年龄以30岁以下者为多见；乳腺癌的乳房肿块可呈圆形或卵圆形，亦可呈不规则形，质地坚硬如石，肿块表面欠光滑，活动度差，易与皮肤及周围组织发生粘连，肿块可迅速生长，可呈无限制地生长而长至很大，同侧腋窝淋巴结常有肿大，发病年龄以35岁以上者多见，尤以中老年妇女多见。乳房钼靶X线摄片，纤维腺瘤可见圆形或卵圆形密度均匀的阴影及其周围的环行透明晕；而乳腺癌可见肿块影、细小钙化点、异常血管影及毛刺等。必要时针吸细胞学检查及活组织病理检查可提供组织学证据进行鉴别。