锁骨上方脖子根部疼痛原因如下：
1、落枕的现象，由于在夜间睡觉时枕头过高或者过低，不良的睡姿等原因导致出现落枕情况，会引起脖子的疼痛不适的症状，这种情况一般几天内可以自然缓解。
2、脖子韧带拉伤。脖子过度劳累易导致颈部根部疼痛，可进行适当按摩，针灸治疗，注意颈部保暖。
3、脖子受凉，胸锁乳突肌受凉易导致肌肉酸痛，应注意保暖。
4、淋巴结肿大或淋巴结炎。颈部反复牵拉引起炎症，加之颈部的经常运动加剧病情，平时应该注意饮食清淡，涂抹非甾体类药物如吲哚美辛等舒缓。
日常生活中应注意脖子的防寒保暖，不剧烈运动。若是脖子疼痛持续不缓解，建议及时就医。