在临床上自闭症治疗康复的原则是早诊断，早干预，运用科学有效的方法，特别是在临床上进行综合的治疗，以药物治疗，行为治疗，教育训练为主，而且进行长期的治疗干预。
在临床上教育和行为干预训练是最主要最有效的方法，主要是通过训练孩子的人际交往能力，沟通能力，动作技能，个人自理能力，个人游戏能力，学业技能，高级认知能力，自我调剂能力等内容，来帮助孩子进行语言发育，社交训练，或者是掌握基本的生活技能，这是非常关键的行为。
训练主要是帮助自闭症孩子掌握已经养成的良好习习惯，而临床上药物治疗针对于自闭症引发的精神障碍进行调整。