肺孢子菌肺炎患者是否需要终身吃药需根据患者的病情进行决定，而临床上高危患者一般需要终身吃药进行预防。
肺孢子菌肺炎患者的用药主要包括治疗用药和预防用药。治疗用药常规疗程在3周左右。
患者需要终身吃药的情况一般在预防用药中，但是否需要终身吃药还需根据自身病情进行综合考虑，无法一概而论。需要进行预防用药的指征包括：有免疫抑制剂使用患者且已有1次肺孢子菌肺炎发作史；儿童发生严重细胞介导的免疫缺陷病；器官移植受者和AIDS（艾滋病）患者等。预防阶段的疗程应根据病情和临床需要而决定，患者也需要定期随访和注意是否发生不良反应。