神经内科肉毒素治疗主要应用于痉挛性疾病、疼痛性疾病等神经系统性疾病，如面肌痉挛、痉挛性斜颈、疱疹性神经痛、慢性偏头痛等。
肉毒素是肉毒杆菌产生的神经毒素，主要抑制神经末梢释放乙酰胆碱，引起肌肉松弛麻痹，从而达到治疗肌张力障碍等神经性疾病的目的。安全剂量的肉毒素治疗在临床上应用广泛，以面肌痉挛为例，在患者无法口服药物治疗及不能手术治疗的情况下，肉毒素治疗可以作为重要的治疗手段，有效缓解和改善患者的痉挛症状，但是肉毒素治疗不能作为长期治疗面肌痉挛的措施，并且肉毒素治疗有一定的不良反应，如少部分患者可出现面瘫、眼球干涩、复视、吞咽困难等，多在3-8周恢复，反复注射肉毒素者可能会遗留永久性的眼睑无力、口角歪斜等。