彩超没查出肝囊肿、CT（电子计算机断层扫描）却查出，主要与囊肿的具体情况有关。
彩超没查出肝囊肿有可能是囊肿太小，又靠近边缘，医生在看B超时不注意造成漏诊。但是，肝囊肿一般以B超为诊断的首选方法，这种方式对肝囊肿具有较高的敏感性，且没有创伤，即使是小于一厘米的囊也很容易被检查出来，准确率极高，还能确定囊肿的性质、部位、大小、数目等。
另外，CT也能准确显示肝囊肿的部位、大小、范围及性质，确诊率也比较高，因此在病灶扫描明显的情况下，即使囊肿过小，CT也可能查出肝囊肿，但不如B超便捷，费用也比B超高。