以科学的方式饮用蜂蜜水能够养护肠胃、排毒、美容养颜，给身体带来意想不到的惊喜。反之，错误的冲泡及饮用方式不仅会破坏蜂蜜水的营养物质，亦达不到养胃养身的效果，不论是冲泡方法或是饮用时间都有一定的讲究，只有根据正确的方式进行饮用，才能充分发挥蜂蜜水的功能。
蜂蜜水的最佳饮用时间是饭后的半个小时至一个小时以内。但需要注意的是，我们要根据肚子的饱胀感来辨别是否适合饮用蜂蜜水，空腹不宜饮用蜂蜜水，过于饱腹也不宜饮用蜂蜜水，一般而言，肚子七八分饱后，再间隔半小时饮用蜂蜜水是最好的，而温蜂蜜水较之凉开水及开水冲泡作用力将会更强。
除此之外，睡前的一至两个小时前也是蜂蜜水的最佳饮用时间。此时此刻，人体处于平静状态，胃酸亦处于平稳的分泌状态，在这个时候饮用蜂蜜水便能够起到良好的养胃作用。但是不宜在饮用蜂蜜水后就立即睡觉，否则会适得其反。
对于低血糖的人而言，每天早餐时配合饮用适量的蜂蜜水也是不错的选择。但是冲泡蜂蜜水时不宜用热开水，以60℃左右的温水为最佳选择，需要尤为注意的是，早餐时段需要先喝一点温水后饮用蜂蜜水，而糖尿病患者以及未满一周岁的婴幼儿是不宜饮用蜂蜜水的。
每天下午三至四点左右也是饮用蜂蜜水的最佳时间。这个时候人体经过一天的工作之后体能消耗较大，用温水冲泡蜂蜜水饮用，可以及时的补充能量，消除身体的疲劳感，恢复良好的工作状态。对比于咖啡等其他提神饮品，蜂蜜水非但没有任何副作用，亦能够深入性的养护身体，是个不错的选择。