碘伏具有广谱杀菌作用，可杀灭细菌繁殖体、真菌、原虫和部分病毒。在医疗上用作杀菌消毒剂，可用于皮肤、粘膜的消毒，也可处理烫伤、治疗滴虫性阴道炎、霉菌性阴道炎、皮肤霉菌感染等。也可用于手术前和其它皮肤的消毒、各种注射部位皮肤消毒、器械浸泡消毒以及阴道手术前消毒等。
但碘伏消毒液因其本身稳定性较差，易产生沉淀和碘的升华结晶、挥发，在药液有效期内碘的含量降低率较高，会影响到正常的消毒杀菌作用，因此它的保存问题令大家尤为关心。
在中国医院感染规范化管理sific常见问题释疑》一书，当中有明确指出：在缺乏有关循证医学证据的情况下，小包装的消毒剂应参照三联瓶密闭保存的消毒剂的要求执行，即每周更换2次。但是对于大瓶的消毒剂，没有明确规定，但是在医疗室里大瓶的750ml不直接使用，只是倒在棉球或纱布缸内使用。如开启次数不多可酌情增加时间。
同时，国卫办医发（2013）40号，关于印发基层医疗机构医院感染管理基本要求的通知：四、重点环节（一）安全注射 盛放于皮肤消毒的非一次性使用的碘酒、酒精的容器应密闭保存，每周更换2次，同时更换灭菌容器。一次性小包装的瓶装碘酒、酒精，启封后使用时间不超过7天。
在平时的使用中，包装碘伏消毒液有效期均为24个月，如果开封后一直是放在避光、阴凉、干燥处放置的，那么从开封到有效期内均可以正常使用；如果已经放置过久，但因保存不当，有大量的沉淀和结晶物，就说明消毒液本身已经接近失效了，可以重新购置新的消毒液才可以更好的起到杀菌消毒的作用。