甲胎蛋白是一种特殊的糖蛋白，患有肝癌后，甲胎蛋白指数会呈指数性增长。因此，甲胎蛋白可作为原发性肝癌的标志物，可以为早期肝癌的诊断提供一定的诊断依据。但是甲基蛋白指数本身与肝癌之间并不存在必然关系，并不是说人体血液中甲胎蛋白水平达到一定高度就可以判定患者一定患有癌症。因此，“甲胎蛋白高多少是肝癌”这种说法是错误的。
医学上可以根据甲胎蛋白水平推测患有肝癌的概率。例如，若患者甲胎蛋白水平高于200μg/L，且维持这样的水平持续8周，推测有患肝癌的可能性；若患者甲胎蛋白水平高于400μg/L，且维持这样的水平持续4周，推测患有肝癌的可能性将更高；若患者甲胎蛋白水平高于800μg/L，患有肝癌的概率在90%以上。但是，这种推断方式不但要结合患者具体症状，考虑是否存在肝区疼痛、腹部胀满、消化不良等症状，还需要完善肝脏核磁共振、肝穿刺等病理检测，才可以得出精准结论。
出现这种情况的原因是由于甲胎蛋白受多种因素影响，尤其是部分肝脏疾病患者体内的甲胎蛋白水平甚至比肝癌患者更高，因此单纯依靠某种物质的含量推断是否存在肝癌是不准确的。并且疾病患者甲胎蛋白处于标准范围以内，即血液中甲胎蛋白含量低于25μg/L，也不能排除肝癌的可能性。临床有将近三分之一的小型肝癌患者不会刺激甲胎蛋白分泌，也就不会导致甲胎蛋白水平上升。
总而言之，若患者检测发现甲胎蛋白处于较高数值，提示有肝癌的可能性，但无法为肝癌的确诊提供决定性证据。建议患者出现此类症状后，及时完善其他类型检测。如果能够对甲胎蛋白持续监控，甲胎蛋白水平波动可为肝癌的确诊提供一定的数据支持。