一般情况下，肛门如果长小疙瘩是由于痔疮或者是肛门湿疹等原因导致。患者如果是由于痔疮引起的肛门起小疙瘩，建议先采取保守治疗，保守治疗无效的情况下，可以采取手术治疗。对于肛门湿疹引起的小疙瘩，建议患者采用保守治疗。
肛门起小疙瘩的原因
1、外痔以及外痔的皮垂。常由于肛周静脉曲张，血管迂曲，形成外痔，痔核长期存在，会形成纤维性皮垂。
2、内痔。直肠黏膜下血管迂曲明显，突出于肛门外，可形成内痔脱垂，脱出肛门外形成疙瘩，表现为局部无痛包块，大便时常有滴血的现象。
3、肛周脓肿。表现为肛周疼痛，同时有肛周疙瘩，病情进一步恶化会形成肛瘘。
肛门起小疙瘩怎么办
1、建议做手术切除，一般考虑是痔疮所引起，也可以采取栓剂、洗剂、治疗静脉曲张的药物进行治疗，具体情况看患者要求。
2、如果患者通过保守治疗无效，也可以采取胶圈套扎治疗，这种也是普通外科常用的治疗方法，所以可以采取积极应用。对于早期的内痔，也可以在黏膜下注射硬化剂来进行治疗，并且要注意肛周卫生，预防感染。
3、可以应用超声多普勒引导下痔动脉结扎术，这个也是比较好的方法，比普通手术要更加的先进，应用激光光凝方法手术切除的方式也是比较好的。所以可以选择手术治疗，这些治疗方法根据个人意愿进行选择治疗。