便血引起肛门疼痛的疾病比较多，比如肛裂，每次排便的时候会造成肛门撕裂，撕裂以后会引起疼痛，大便完以后疼痛进一步加重，有的患者持续半小时，有可能持续五六个小时。第二，痔疮，内痔脱出来之后也会引起疼痛。外痔，患者大便时刺激肛门，肛门收缩，引起外痔的出血，形成血栓，之后也会出现剧烈的疼痛。还有肛周脓肿，肛周皮下感染之后，在大便时会非常的疼痛。
一、便血肛门疼痛的原因
1、长期有肛裂：这是一种慢性疾病，有肛裂的患者在大便时候，粪便及消化液会刺激肛内创面引起疼痛。
2、混合痔脱出：脱出以后混合痔的创面发生糜烂、感染，这样在大便的时候有粪便污染，也会引起疼痛。
3、先天因素，例如是不是有肛门狭窄。
4、肛门过去是否有手术史，有手术史的肛门就会呈疤痕性挛缩，致使肛门狭窄，在用力大便的时候会刺激肛门的扩张损伤皮肤，引起剧烈疼痛。
二、肛门便血怎么治疗
1、肛门疼痛伴有排便带血，是发生于齿状线下方的疾病，因为体神经支配的范围对痛觉比较敏感，常见的是血栓性外痔、肛裂、肛瘘或者肛周脓肿。
2、诊断明确后通常来说都需要进行手术治疗，对于外痔可以局部麻醉下做梭形切口将病变切除，保留创面，剥离栓子，预防出血。
3、对于肛瘘要详细明确是简单性的，还是复杂性的，对于浅表性、单纯性的肛瘘，可以进行瘘管的切开缝合，而复杂性的肛瘘需要进行挂线疗法，注意避免损伤肛门括约肌，导致术后排便功能障碍。
4、单纯的肛裂也可以选择手术。平时应该注意饮食结构，多吃蔬菜和水果，积极治疗习惯性便秘，这些疾病都是可以预防的，也要注意局部卫生，最好坚持每天进行坐浴。