核磁共振是目前比较安全一种检查方式，对身体一般是没有副作用的，对于婴幼儿来说，只要配合检查，一般是没有副作用的。在做核磁共振的时候，一定要掌握相应的适应症，婴幼儿做核磁共振的时候，家长一定要注意安抚好孩子的情绪。
幼儿做核磁共振的危害
1、核磁共振是利用磁场的原理来对人体进行断层扫描检查，对人体是没有害处的。如果幼儿考虑可能存在颅脑等部位的疾病，是可以行磁共振检查的。与CT，胸片的原理是不同的，后两者主要是X线，可以引起辐射。
2、核磁共振主要是利用磁场成像的原理，对人体进行相应的检查，是目前成像检查最好的设施，其安全、有效、又没有放射性，所以婴儿做核磁共振安全，主要用检查脑部疾病。
做核磁共振的注意事项
1、装有心脏起搏器，胰岛素泵的患者，早孕者（3个月以内的），或者人工耳蜗，体内植入不锈钢金属物的，是严禁进入检查间的，有这些情况的患者是不可以做核磁共振的，其他的金属，如钛合金不影响核磁共振的检查。
2、核磁共振是强磁场，担架车和轮椅是绝对不能进入检查室的，以免造成生命危险，病人和陪同进入检查室的家属必须去掉身上所有的金属物，如腰带、手机、手表、钥匙、硬币、磁卡、打火机、金属首饰、假牙、助听器等。
3、做核磁共振时有磁场效应，声音较大，做颅脑核磁共振，大概需要15分钟左右，幼儿不能配合的情况下，一般需要提前应用镇静剂来镇静安眠。