新生儿甲状腺功能异常包括先天性甲状腺功能减退、暂时性甲状腺功能减退和甲状腺功能亢进。新生儿筛查怀疑为先天性甲状腺功能减退，经甲状腺功能检查确诊为先天性甲状腺功能减退者，应立即开始充分的甲状腺素替代治疗，并定期复查甲状腺功能。根据婴儿体重增长和甲状腺素水平调整用药剂量，终身服用。暂时性甲状腺功能减退在早产儿中很常见。还需要开始口服甲状腺素，定期检查，当甲状腺功能恢复正常时停止服用。
新生儿甲亢的主要特点
1、母亲多为甲亢患者。出生时或数日、数月后，会出现甲状腺功能亢进的表现，如潮红、烦躁、多动、易激动、出汗、呕吐、腹泻、甲状腺肿、发热等。如果母乳喂养能力增加，体重不增加，容易发生呼吸衰竭、心动过速、心律失常、心衰等症状；
2、由于新生儿甲亢的促甲状腺激素受体抗体来自母亲，不是自身产生的，随着时间的推移，促甲状腺素受体抗体也会自行缓解，甲亢症状也会逐渐缓解，因此大部分患者在出生后1~3个月内未经治疗即出院，患者会自行缓解，一般不会复发；有时不能自行缓解的患者可及时给予相应的治疗方法。
3、新生儿甲亢的特点是多动、易激动、出汗、呕吐、腹泻和发热。如果母乳喂养能力增加但体重不增加，就容易发生呼吸衰竭、心动过速、心律失常和心力衰竭。