叶酸缺乏
叶酸也叫维生素B9，是一种水溶性维生素，也是孕早期胎儿生长发育必不可少的营养素。孕早期的妈妈体内叶酸缺乏，会影响胎儿神经管闭合，从而出现神经管畸形。所以一般都建议孕妇在怀孕前三个月和怀孕后的头三个月内服用叶酸，这样可以有效降低神经管缺陷的发生率。
2药物影响
孕早期的准妈妈服用了某些药物也可能导致胎儿神经管畸形，比如抗惊厥药物。
3遗传
无脑儿、脊柱裂等神经管畸形多为基因遗传，家里有过这样的夫妻应慎要孩子。
4其他
孕早期剧烈孕吐，或妊娠合并糖尿病酮症酸中毒等内环境异常时，也可能影响神经管闭合，导致胎儿畸形。另外，孕早期有高热或长期在高温环境中工作的女性胎儿神经管畸形的发生率会更高。