腹部两侧疼痛的原因较多，包括肠部病变、阑尾炎、肾脏的病变等，女性不排除附件病变等疾病。
1、肠部病变：腹部两侧分布升结肠和降结肠，出现肠部病变时可导致腹部两侧疼痛，如溃疡性结肠炎、急性胃肠炎、结肠肿瘤、肠梗阻等，需结合血液检查、肠镜影像学检查确诊，明确病因后对症治疗。如溃疡性结肠炎可以用美沙拉嗪等药物；如肠梗阻，保守治疗需要胃肠减压和补充电解质等治疗，严重时需要手术治疗；
2、阑尾炎：典型表现是转移性右下腹疼痛，一开始可能会出现上腹部或腹部两侧疼痛，而后出现右下腹疼痛，需结合彩超、影像学、血液分析明确诊断；病情较轻的患者以抗感染治疗为主，可以选择头孢曲松和甲硝唑；病情较重的需要手术切除阑尾。
3、附件炎：卵巢及输卵管的炎症也可引起腹部两侧疼痛，需结合彩超、影像学检查等鉴别，明确诊断后需要抗炎、抗感染治疗，药物选择需要根据病原菌检测选择敏感的抗生素。
4、肾脏病变：如肾结石、肾肿瘤、肾病综合征等。肾结石可以选择碎石治疗，肾病综合征根据病情治疗可以选择激素、吗替麦考酚酯等药物治疗，肾脏的肿瘤一般需要手术治疗。