中医药和西医药有着本质的区别，其本质主要体现在以下方面：宏观和微观的观察角度;辩证论治和鉴别诊治的方法论;整体调理和局部处理等等区别。可以说中医药和西医药是两种世界观、价值观和方法论的完全不同疾病治疗系统。
笔者认为，中药现代化不可行，是对中医药的误解，理由如下：
第一：中药现代化的观念总体上与中医辩证施治的核心思想相左。
中药离不开中医，中医强调人体是一个系统，五脏六腹、气血经络等等相互影响。中药现代化，首先药中医现代化，而中医的最精华的部分就在于辩证施治，根据望闻问切的结果，根据不同人的体质和治疗进程的不同，和不同药物的药性，给予不同的组方。中医药中异病同治、同病异治、冬病夏治、整体调理等最科学的东西，在微观的西药来说却是不可重复，最不科学的东西。中药制成成药后，由于无法辩证，因此一些好的中药也就打了折扣。
中药现代化，提取有效成分后，也就无法辩证施治了，无法根据不同人的体质、不同的用药进程给予不同组方用药来治疗了。
第二：现代化的将使复方组方失去优势。
中药讲求复方治疗，组方配伍颇有一番理论和讲究，因此才有了复方的协同效应，君臣佐使各司其职，科学配伍使各药作用倍增，对于植物药来说，一种植物里面的成分就很难彻底弄清，复方后到底那种成分其作用，较难说清楚，也许是几个成分协同作用的结果。提取单体后中医的协同作用和整体调理的治疗观将不复存在，中药将不在是中药了。
第三：中药现代化加工质量无法保证。
中药饮片和汤药的炮制和煎熬过程十分繁杂和讲究，这也是同仁堂训中：“炮制虽繁必不敢省人工，品位虽贵必不敢减物力”的精髓所在。这与陈年老酒的窖藏颇有相通之处。试问繁杂精细的中药炮制加工如何现代化，现代化了后还能保证中药的药力吗?须知不同加工炮制方法会使中药效果大相径庭!还有同一味中药不同部位的药性用途也完全不同，机器怎样来区分它们的不同部位来炮制。
文火煎熬，现代化怎样定义文火?!
第四：中成药现代化很难确定检测标准。
众所周知，很多中成药的检测是只做定性检测，不做含量测定，即定性不定量，这固然造成了一些伪劣药，但是应该看到，很多中成药根本就无法含测，即使含测也不一定就科学，因为你不知道具体的起作用成分是什么，你也就无法确定该检测那个指标，这样你连现代化的标准都没有，遑论现代化。而且现代化了，药效也不一定是最好的!
第五：中药讲求原产地和野生，现代化无法解决这一问题。
橘生淮南则为橘，生于淮北则为枳。药材更是如此，南北板兰根的作用就有区别，不同产地的药材，效果相差很大。尽管国家有GAP基地之说，但是药材还讲求深山老林野生。用农药化肥种出来的中药材，其效果怎么可能好。中药材和中成药出口重金属超标就是明证。
现代化意味着规模化生产，规模生产必然是规模种养殖，这样的药材质量一定是会大一定折扣的，尽管有GAP标准，但也无法避免这点。
第六：中医药是靠经方验方治病，医术靠师傅带徒弟相传，无法现代化。
中药治病，很多都是千百年来的验方、经方、祖传秘方。给药量上也会因个体差异而有所区别，中药现代化就会失去这一优点、优势。也就没有了辩证施治和具体问题具体分析。中医医术更要靠师傅带徒弟或者是祖传。脉象滑，无师傅带着你去在具体的患者身上感觉，你理论上知道了，但实践上还是不知道什么是脉象滑。中药的文化背景是无法现代化的，现在的中医异化，中药医生西医化，医术下降，给中药疗效蒙羞，应是中医界的耻辱。
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