有些中草药本身就具有一定的毒性，如斑蝥、生南星、附子、乌头、一枝蒿、川椒、蜈蚣、甘遂、芫花、朱砂、雄黄、大戟、商陆、巴豆等，它们所含的各种生物碱及化学成分十分复杂，有的可直接或间接影响胎儿的生长发育。尤其是怀孕的最初3个月内，除慎用西药外，中草药亦慎用，以免造成畸胎。中药雄黄肯定有致畸胎儿作用，孕妇应绝对禁忌内服。朱砂含有可渗性汞盐(即水银)，可在孕妇体内蓄积，导致新生儿小头畸形、耳聋、斜视、智力低下等。
需引起孕妇重视的是，许多有毒副作用的中草药，常以配方形式出现在中成药之中。所以对含上述中草药的中成药须警惕，对注明有孕妇禁用、慎用的中成药，应避免服用。当然，孕妇患病也应及时治疗，勿讳疾忌医。更何况在数千种中草药中，有不良作用的毕竟是极少数。因此，在就诊时应向医生说明自己已怀孕，请医生权衡利弊，尽量选择安全无副作用的药物。
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