进入新的发展阶段，新科技潮流对人才的要求越来越高，有质与量的双重要求，如何应对机遇与挑战，顺应教育发展形势和社会需求，如何更好地通过自主招生促进素质教育与新课程改革，为高等教育更有效地选拔创新型人才，是摆在招生考试工作者面前的一个课题。
普通高校自主招生队伍从2003年开始的22所高校，到2006年的53所，逐年扩大，经历了从试点到改革，再日渐成熟的阶段，借助科学合理的招生方法从广大的应届高中毕业生中选拔了一大批优秀人才，自2006年起，香港高校也在内地开始自主招生。
根据几年来的实践，可以看出，自主招生确实是对以统一高考为主的高等教育招生的有益补充，目前统一高考是国内最公平、最公正、公信力的统一考试。对于高招而言，统一高考还有高效招录、易大规模实行、省时省力的特点，而自主招生则具有利于发现创新能力型学生、更体现对特长学生个体的人文关怀之特点，所以统一高考与自主招生起到了相互补充的作用。
笔者认为，在经过一定阶段发展后，自主招生的测试方法、测试内容、专家选聘、审核程序、评价录取、监督机制等方面将日趋完善，学生除了通过考试取得成绩，以接受相应的高等教育外，还能凭借出色的创新能力与优秀的综合素质自主地选择具有专业学术优势的重点高校，主动地为未来发展创造机遇与条件，与此同时，新课程改革、素质教育也就有了更广阔、更富创造力的发展空间。
与此同时，自主招生还需要逐步取消一些条件限制。如地区条件限制、高中生源条件限制、分数条件限制、特长项目的限制等。现在部分高校的自主招生划定了一定地区，只招收指定省市的学生。以后可逐步由指定部分省市范围的自主招生改为全国范围的招生，中西部学生可以多一些脱颖而出的机会，对高校来说可能会增加一些人才选拔与培养成本，但对整个教育事业来说是一个很大的贡献，能从某些方面促进中西部的科技产业进步与发展。
目前，也有部分高校指定招收重点高中应届毕业生，如果招生对象扩大为重点及普通高中应届毕业生，只要拥有相应的素质，同样都是具有培养前途的对象，若普通高中应届毕业生具备了与重点高中应届毕业生相当的水平，则有些普通高中应届毕业生可能更具备专业天斌与潜力。此外，高校可适当增多自主招生中的特长项目，如招收体育特长生可将乒乓球、武术、击剑、网球、手球、棒球、棋类等项目都考虑在内。
在自主招生测试与面试中，可考虑扩大知识面、增加层次、提高水平、侧重专业性，重视对基本功、平时知识积累的考查，也重视对科学探索、创新能力、敏锐观察力、分析与解决问题能力的考查，让优秀学生可以脱颖而出。文科的测试应至少覆盖语文、数学、英语、历史、政治，理科的测试应至少覆盖语文、数学、英语、物理、化学，也多组织如综合测试、面试、特长竞赛、冬令营等活动，通过综合性的考查发现学生的优势与长处，高校为此增加的成本是值得的，可以为日后的因材施教打下良好的基础。
如某院校举办的人文知识大奖赛是一个非常好的活动，参赛学生在有关文学类、历史类、哲学类、文物与博物馆类的知识竞赛中可以充分发挥潜能，通过活动能对汉语言、汉语言文学、历史学、哲学、博物馆学等专业有丰富的感性认识。
测试、竞赛等活动着重考查学生的知识水平、基本素质、学科特长，面试、冬令营等活动着重考查学生的能力、情商，尤其要尽可能详细地了解学生分析、解决问题的能力，感受环境与随机应变的能力，逻辑推理与分析问题的能力，口头表达与互动交流的能力以及是否具备健康情操。这些对日后的学习与工作大有影响，也在很大程度上决定了培养出来的人才是否是栋梁之才。
这样的自主招生可促进学生有意识地培养自己多方面的能力、并形成正确的人生观、世界观、价值观，起到促进学生平时均衡发展的导向作用。此外，自主招生不一定停留在本科层次，专科教育也需向社会提供高素质的专业人才，这样的人才也能有效地通过自主招生进行选拔。高职的自主招生有益于扩大院校办学自主权、全面体现学生技能素质，还能促进各层次学生与高校之间进行的双向选择。近几年各地的多所院校都进行了这方面的实践。
为了保证自主招生的公平公正，应常设自主招生工作的监督机构，除招生院校自己的招生举报与监督机制外，上级主管部门应经常监督指导，社会与媒体也要予以监督，加大招生透明度，提高自主招生的地位，扩大院校的知名度。从公信力的角度维护自主招生的权威性，保证自主招生的公平合理及健康成长。
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目前国内高校的自主招生有五种基本实施模式。第一种是学生先参加重点高校自主招生测试再参加高考，其特点是高校对通过自主招生测试且高考成绩不低于一定分数的学生予以录取；第二种是对参加重点高校自主招生测试排名居前，且综合评价优异的学生予以保送，此批学生不再参加高考，特点是优中取优；以上两种形式是目前内地高校最主要的自主招生形式，清华、北大等院校都采用这种方式。
第三种是部分香港高校对内地学生组织的自主招生，其特点是对学生的实际英语能力、沟通与表达能力要求较高，有关的面试全部以英语交流方式完成，招生过程一般安排在7月前完成，以避免内地与香港的高校对申请者的重复录取；第四种是直接由个别重点高校采取试点的办法，自主选拔直接录取，高考成绩作为一定的参考成绩，如复旦大学、上海交大的自主选拔录取。
此外，部分院校高职专业的自主招生，对申请者直接通过本校测试择优录取到高职专业，特点是直接确定就读专业，不再参加高考，如北京信息职业技术学院、宁波职业技术学院等。除五种实施模式外，各高校还有根据自身特点设立的自主性质的特色招生，如北京大学的影视编导艺术特长生、体育特长生招生，如复旦大学的博雅杯、体育、艺术特长生招生，等等。