着眼于知识重组的原则
在第一轮复习的基础上进行的第二阶段专题复习，从本质上讲，是将学过的知识和已经具备的基本技能和方法运用于解决问题的一种复习。因此，专题复习不应再注重知识结构的先后次序，应该本着问题的提出、分析和解决的思路，去寻找所需要的、有用的方法和技能；本着解决问题的目的，将知识进行必要的拆分、加工和重组。
如：设计某一专题复习时，首先应从讨论问题的思维主线入手，引导学生从全新的、应用的角度进行思考，形成不同于基础复习的思维方式，即分析的思维主线；其次，进入主题内容分析，让学生按照上述分析的思维主线进行分析训练。
在训练中，可以采用课堂提问、练习作业或小组讨论等形式，教师要引导和促使学生进行思维训练和知识重组，从而在思维水平上逐步接近高考的要求。最后，选择高考实战题进行例析讲解，目的依然是强化学生的知识重组意识和思维线索的形成。教师在复习策略上，切忌简单的机械重复和平面化的“专题复习”，要精心设计，打破知识和技能的固有结构壁垒，让学生形成触类旁通、举一反三的思维状态。
建立完整能力结构的原则
高考改革已经由“知识立意”向“能力立意”转变，并将继续深入下去。在完成基础知识复习的前提下，学科能力的逐步培养和有针对性的训练是本阶段的首要任务。在熟知的学科知识结构的基础上，教师和学生要善于发现和建立本学科的能力结构。
在学科能力结构中，学科的思维能力是核心，是学好这门课的灵魂。让学生具备了相应的思维方法，应该说就是具备了在高考中应对各种新情境、新变化的能力，这是制胜的关键。学科的识记能力是基础，知识的掌握是能力提高的载体，基础知识和基本技能永远是不可少的。学科方法和技术能力是“人题界面”，是直接发生在考生和考题之间的“能力”，理所当然地成为我们共同关心和着力培养的能力。不同的学科有不同的思维方法和解题技巧，教师在复习中要挖掘，并潜移默化地传授给学生。学科表达能力是通过试卷外显出来的，长期以来考生存在的“答不到点上”、“逻辑性差”等问题都是这一能力欠缺的表现。从本阶段起，考生的每一道练习都要按照高考答卷要求，做到严谨、精练、准确。
实际联系理论的原则
理论联系实际是任何一个学科复习的基本原则，但在专题复习中，要特别注意思维的逻辑次序。在学习新知识和进行基本复习时，思维逻辑次序是正向的，即复习完一定的理论、知识和技能后，到生产和生活实际中去寻找实际的例证，加以剖析和验证，从而强化对知识的理解、对原理的认识，以及对技能应用的检验。这一理论联系实际的过程，在理论的运用上往往具有“相对集中性”，所涉及到的内容会限定在某一特定的知识范畴内。这一过程对于活化书本知识是至关重要的。
第二阶段的复习设计，必须有案例分析。特别是综合性试题的选材设计在这个阶段是必须加入的，所选择的材料必须能承载多个学科的学术信息，以训练学生可以联系不同学科的知识理论来解题。这种材料在现实生活中的确存在，但常常不是基础教育的内容所能包容和驾驭的，为此教师要对材料进行处理，使其内容延伸、触及到各学科的领域内。