甲状腺多发结节原因可能是多发的甲状腺囊肿、结节性甲状腺肿等疾病，甚至可能是恶性肿瘤。
1、多发甲状腺囊肿：甲状腺囊肿可见于患有甲状腺功能异常、甲状腺炎等背景的患者，正常人偶尔也可发生甲状腺囊肿，甲状腺囊肿超声分级一般为1类，恶变概率极低，所以体积较小的囊肿可以定期观察，对于较大的囊肿（如＞3cm）、有影响外观等情况，则可考虑行穿刺抽液等处理。
2、多发结节性甲状腺肿：结节性甲状腺肿以多发为主，多见于甲状腺功能亢进或低下、甲状腺炎等患者，结节一般为良性的，如果彩超未见恶性征象、结节不大，则定期复查即可；对于结节较大、引起压迫症状、或者怀疑有恶性倾向的结节，需考虑行穿刺活检或手术治疗。
3、甲状腺恶性肿瘤：甲状腺恶性肿瘤可能多发，也有可能发生于结节性甲状腺肿的背景下，一旦甲状腺结节有怀疑恶性可能，均应尽早完善穿刺活检，明确病情，对症治疗。