智飞疫苗第二针和第三针间隔是4-16周，但需注意的是第三针需在接种第一针后6个月内完成。
智飞疫苗为重组亚单位疫苗，根据《新冠病毒疫苗接种指南》规定，重组亚单位疫苗是需要接种3剂的，其接种间隔时间的具体为：相邻2剂之间的接种间隔建议≥4周，第2剂尽量在接种第1剂次后8周内完成，第3剂尽量在接种第1剂次后6个月内完成。也就是说智飞疫苗第二针和第三针间隔是4-16周。
且需注意的是，第三针的接种时间要根据第二针的接种时间来进行相应调整，若第二针接种的时间较晚，第三针接种的最长间隔时间要缩短，只要不超过接种第1针后6个月就可以。