盆底肌检查和阴超相比，盆底肌检查有时会疼一些。
阴超即阴道超声，操作是把超声仪器的探头放入阴道内，再通过显示器观察子宫和双侧附件的情况，放置探头时患者可能会有一定程度的不适，但不会疼痛。
盆底肌检查是将压力棒放入阴道内，患者需夹住压力棒，根据仪器显示的数据来检测盆底肌状况，或将仪器探头放入阴道内，通过患者盆底肌主动收缩和放松的方式检查，所以一般不会有疼痛，但是对于因为性交痛或者慢性盆腔痛就诊的患者，可能放置盆底肌检查的探头或者阴超探头都会引起不适，尤其是本身阴道黏膜破损的患者，阴道的检查或者操作都可能会刺激诱发疼痛。