经颅多普勒和颈动脉彩超区别主要表现在检测部位、检测对象等方面。
1、检测部位：经颅多普勒的检测部位主要是颅脑部，主要经颞骨嶙部（颞窗）和枕骨大孔（枕窗）两个部位，检查脑动脉血流状况；颈动脉彩超的检测部位主要是颈部，常用于检测颈总动脉、颈部动脉、颈内动脉、颈外动脉等动脉。
2、检测对象：经颅多普勒的检测对象是各种颅内血管性疾病，比如脑动脉狭窄、脑血管痉挛等；颈动脉彩超的检测对象是颈动脉壁的各类病变，比如动脉粥样硬化等。
临床上，经颅多普勒和颈动脉彩超常联合应用，能提高疾病的检出率以及诊断正确率，能为疾病的治疗方法和治疗效果的评估提供一定的依据。