霍斛和石斛可以通过以下不同方面进行区别：
1、性状不同。霍斛一般长约3至9厘米，有约3至7节，不分枝；而石斛一般长约15至20厘米，呈圆柱或扁圆柱形。
2、颜色不同。霍斛整体呈淡黄绿色，偶尔会有淡紫红色类似铁锈一样的斑点，风干后一般呈淡黄色；石斛一般为黄绿色或青绿色。
3、横切面细胞学形态不同。石斛表皮细胞1列，扁平，外被鲜黄色角质层。基本组织细胞大小较悬殊，有壁孔，散在多数外韧型维管束，排成7～8圈。维管束外侧纤维束新月形或半圆形，其外侧薄壁细胞有的含类圆形硅质块，木质部有1～3个导管直径较大。含草酸钙针晶细胞多见于维管束旁。
霍山石斛 表皮细胞1列，扁平，外壁及侧壁稍增厚，微木化，外被黄色或橘黄色角质层，有的外层可见无色的薄壁细胞组成的叶鞘层。基本薄壁组织细胞多角形，大小相似，其间散在9～47个维管束，近维管束处薄壁细胞较小，维管束为有限外韧型，维管束鞘纤维群呈单帽状，偶成双帽状，纤维1～2列，外侧纤维直径通常小于内侧纤维，有的外侧小型薄壁细胞中含有硅质块。草酸钙针晶束多见于近表皮处薄壁细胞或近表皮处维管束旁的薄壁细胞中。
4、价格和药用价值不同。石斛和霍斛都对肠胃和肝有良好的作用，但霍斛还可以降血糖，因此霍斛的价格一般会高于石斛。