新生儿房间隔缺损是先天性心脏病的一种表现，造成这种症状出现的主要原因包括以下几点。
第一，遗传因素。心脏病就有很强的遗传性，特别是先天性心脏病，可以通过基因遗传以及染色体变异等方法进行遗传。
第二，心脏结构发育异常。胎儿在母体的子宫发育阶段，由于多种内外因素的影响，很容易出现心脏结构发育异常的情况，最终导致房间隔发育不全的症状出现。
第三，宫内感染。如果母体出现不健康的生活习惯以及饮食习惯，或者是药物的副作用等，很容易造成子宫内胎儿受到感染的情况发生，最终影响到胎儿正常的生长发育，造成心脏发育畸形的情况出现。