丘脑出血发病两周之内一般属于急性期，主要是适合手术的情况下要进行手术治疗，一般要进行保护治疗包括降颅压治疗和神经保护治疗，并积极控制患者的病因。常见的病因有高血压以及动静脉畸形和脑动脉瘤，患者同时要进行神经保护治疗，主要应用奥拉西坦。如果患者病情稳定后，同时要进行针灸治疗和康复治疗，发病两周后一般多数患者病情趋于稳定。
如果患者长期卧床时容易起下肢深静脉血栓，形成导致肺栓塞而引起患者死亡，应被动或者是主动活动下肢。必要的情况下应给予气压治疗，防止下肢深静脉血栓形成，并定时翻身拍背，防止吸入性肺炎和褥疮感染。