脑垂体萎缩在临床中也是比较少见的，有时在内分泌科门诊中会遇到脑垂体萎缩患者，脑垂体萎缩也就是脑垂体较正常垂体组织变小，这种情况一般见于年老体弱的人，长期有慢性疾病、体质消耗的人，或者是自身免疫性垂体炎，最常见的就是产后大出血引起的，腺垂体功能减退，可以引起脑垂体的萎缩。
上述疾病都可以引起脑垂体缩小这种情况，同时会出现垂体功能的减退，一般患者查性激素6项中，促黄体生成素以及促卵泡刺激素、促甲状腺激素、促肾上腺皮质激素均会出现明显减低的情况，所以它的靶腺功能会明显受到损害。
一般在临床上会出现继发于垂体引起的甲状腺功能减退，性腺功能减退，以及肾上腺皮质功能减退，需要给予激素替代治疗，维持靶腺的功能。