小男孩睾丸被CT（电子计算机断层扫描）扫描的处理方法应根据情况而定。
1、由于睾丸本身可以做CT检查的，一般CT的辐射量对人体来说属于安全范围内。单纯一两次CT检查一般不会对睾丸部位造成损伤，对睾丸及其他生殖器的影响不大，因此无需特殊处理。
2、人体的生殖器官对放射线是比较敏感的，而小男孩身材较短小，比如做全腹CT会容易扫描到睾丸，偶尔一两次也是没有明显影响的。若是长期或频繁接触放射性照射，有可能会影响到生殖器的发育等，可以先到医院儿科或泌尿科，检查一下睾丸的功能，再根据医生意见建议，进一步处理。
建议进行CT扫描需提前做好屏蔽措施，比如用铅板遮挡睾丸部位。