身体莫名酸痛的原因包括生理性原因和病理性原因。
1、生理性原因：长时间没有进行锻炼，突然进行大量、剧烈的运动，可导致乳酸堆积，刺激肌肉引起酸痛感；从事体力劳动，如在搬运重物的过程中，重物压迫到肌肉，使局部血液循环受阻，可导致肌肉出现酸胀、麻木、疼痛等症状。
2、病理性原因：免疫力下降时，易受到病毒、细菌等感染，导致出现发热症状，使机体的代谢增加，从而使体内酸性代谢产物蓄积，毒素和酸性代谢产物会刺激全身肌肉，引起酸痛、乏力等症状；由于甲状腺功能亢进症，导致甲状腺激素分泌增多，使机体代谢亢进以及交感神经兴奋，可引起肌肉酸痛、麻痹等不适症状。