中医一般指以中国汉族劳动人民创造的传统医学为主的医学，所以也称汉医。而中国作为一个多民族国家，少数民族的民族医学如蒙医、藏医、苗医等同样熠熠生辉。蒙医是蒙古族在长期的医疗实践中逐渐形成与发展起来的传统医学，经历了千百年发展历程，形成了完整的理论体系及独特的用药经验，这与蒙古民族所处地理位置、生活环境及饮食起居习惯等密不可分。而同一种药，蒙医和中医的药用部位、炮制、用法等方面却不同！蒙药和中药有啥区别呢？
药用部位不同
蒙药和中药均属天然药物，并且以植物药为主。而同名不同药用部位的现象较多，如蒙药龙胆药用部位为其花，而中药用其根。
常用程度不同
一部分蒙药和中药属同物同名，但用药频率不同，这种情况很多。如中药甘草在中药复方制剂或处方中出现率较高，而蒙药中只有止咳祛痰平喘的复方和少数止吐复方中出现，甘草在蒙药复方中出现率远没有中药复方高。再如蒙药诃子在蒙药方剂中出现率高达50%，而在中药处方中较少出现。
炮制不同
蒙药多生用，需要炮制的蒙药没有中药多，中药的炮制方法更多，应用更广泛。但蒙药的炮制方法别有特色，主要体现在其所用辅料上，蒙药常用牛奶、马奶、酸马奶、羊肉汤、羊骨汤等作为辅料进行炮制，这与蒙古民族生活环境及饮食习惯等关系密切，如蒙药手掌参的炮制：用牛奶浸泡一定时间，取出，晾干，其滋补强壮作用可加强。
1、功能主治不同
蒙药学基础理论和中药学基础理论完全不同，蒙药学基础理论中有五元、六味、十七效、八性及两力之说，而中药有四气、五味、升降浮沉、归经等内容。各种药味具体性、味、功能主治和临床用法更是截然不同。如蒙药肉豆蔻味辛，性温，用于胸满心烦，叹气，心慌，头晕，失眠，谵语等症，常用于心赫依、心刺痛等病症。而中医认为，肉豆蔻可温中，行气，消食，除痰，固肠，醒酒解毒。治寒凝气滞之心腹胀痛，脾虚或肾虚之泻泄，呕吐，食积腹痛等诸症。
又如蒙药苦参，味苦，性平，有促使热病成熟，发汗，燥协日乌苏，调和三根之功效。临床上主要用于感冒初期、关节病变和皮肤病。尤其常用于感冒发烧，热病初期的蒙药复方中必有苦参。而中医认为，苦参味苦，性寒，归肝、肾、大肠、小肠经。具有清热燥湿，祛风杀虫之功能。主治湿热泻痢、肠风便血、黄疸、小便不利、水肿、带下、阴痒、皮肤瘙痒等病症，常用于治疗带下阴痒、湿疹疥癣、小便不利等。
2、用法用量不同
蒙医治疗疾病一般用复方，并且一天选用多种复方制剂，分早、中、晚服用，即每日 3次 ，每次 1或2种复方制剂，少则每天用 3种制剂，多则每天用 6 种制剂，这是蒙医临床用药的突出特点。而中医传统用药习惯一般每天用一副汤剂或用一两种复方制剂。
蒙药汤剂一般每次用药量较小 (3～5g)，患者每次服用水煎液一般为数毫升至十几毫升。蒙药汤剂一般为成药，患者可在医院和药店买到成药汤散剂。其水煎液中有效成分的溶解较充分，因此其疗效也一直良好。而中药汤剂每次服用数十克以上，由于每剂药量大，水煎液量自然也大，一般每次服用数十毫升至数百毫升水煎液。
3、煎煮方法不同
蒙药汤剂一般煎煮 1次 ，服用其水煎液或连药渣服下。而中药汤剂一般煎煮 2～3次，合并水煎液，分 2～3次服用，煎煮时根据药材饮片的性质与化学成分，有先煎、后下、包煎、另煎等要求。煎煮溶媒方面，蒙药汤剂除了用水外，也常用牛奶或骨头汤。
蒙医和中医都是我们祖国的宝贵财富，虽然理论体系不同，但是一定有许多值得互相借鉴、学习之处，期待蒙医和中医的共同进步。