有许多人，尤其是不善饮酒的人，因为担心醉酒，习惯晚上喝药酒，其实从提高药物疗效的角度来看，晚上服用药酒不如白天服用效果好。
药物的排泄有一定的昼夜节律，药酒在体内清除和代谢的速度以早晨至中午这段时间最慢，加之肝药酶(一种存在于肝脏中的促进药物转化的生物催化剂)的活性也很高，此时血液中酒，药的浓度均很高，有利于发挥治疗作用。
下午两点至夜间0点，乙醇在体内代谢和清除速度最快，则血液中酒的浓度较低，对大脑的抑制作用也最弱，这是因为此时肝药酶的活性最高，同时，肾功能(肾小球滤过率，肾血流量，排尿量和尿素清除率)的最高点在下午5点以后，因此下午至晚上饮酒，在体内的排泄和代谢最快，药效也会过快发挥。但晚上能否喝药酒，应该视药酒的功效与种类而定，睡觉之前如果喝一点添加酸枣仁，柏子仁，龙眼肉等养心安神药物的药酒，对于睡眠欠佳者有安神助眠的作用。
通常情况下，不应该在吃饭时饮用药酒，以免影响药效的发挥;但是滋补性养生药酒，是可以在就餐时饮用的;进餐时或进餐后饮用养生滋补药酒，可以减少酒精对胃黏膜的刺激，并使药效迅速吸收，较快的发挥作用。但由于药酒多由度数较高的白酒炮制而成，所以不要空腹饮酒，因为空腹喝酒容易导致心跳加速，导致头晕。
一般来说药酒一年四季都可以喝，养生药酒最好是冬季喝，其次就是白天喝药酒的效果要比晚上喝好。其实什么时间喝药酒，也是要因人而异的。