急性肠胃炎最主要的是细菌性痢疾的鉴别。一般多数会出现腹泻、大便次数增多，同时有稀水样便或者脓液样便。完善血常规的检查和离子分析的检查，进一步协助诊治。其次，功能性的肠胃紊乱。多数的植物神经功能失调，容易出现肠易激综合征，可以出现急性肠炎的症状。再者，炎症性肠病的鉴别。有些溃疡性结肠炎的出现粘液脓血便，可以表现出肠炎的症状，这是自身免疫性疾病，可以完善消化道钡餐或者肠镜协助诊治。
急性肠胃炎鉴别诊断
1、根据病史，起病急，有上腹部疼痛、不适，恶心、呕吐，食欲不振等消化不良症状，一般可作出急性胃炎诊断。
2、如有酗酒、严重创伤等病史，突发上消化道出血，呈间歇性，可在48小时内作胃镜检查，以明确出血病因，有利于急性出血性胃炎的诊断。
怎么治急性肠胃炎
1、生活饮食调理，在急性发作期要限食甚至禁食，注意清淡饮食，适当的休息。
2、对症处理，如果恶心、呕吐，需服用解痉药物、止吐药物，如果表现为腹痛、腹泻，则需止痛药物、止泻药物，如果腹泻严重，有脱水的情况，需要口服补液盐避免脱水症状。
3、对因治疗，如果病人是感染引起的疾病，根据感染的情况，用抗生素进行治疗，常选用诺氟沙星。
4、个体化治疗，根据病人的自身情况，制定针对性的治疗方案。