睡醒后出现肩膀疼痛，首先应考虑多可能是由于夜晚睡眠时姿势不正确引起。夜晚长时间保持仰卧体位睡觉或者侧卧的体位睡觉要么躺在左边，要么躺在右边。长时间的一个姿势加上睡的床铺比较硬，就会导致肩膀受到挤压，挤压以后，肩膀部位的肌肉会处于紧张，或者肩膀局部的血液循环就会不畅，从而导致睡醒后出现肩膀疼痛的情况发生。出现肩膀疼痛，不能排除由于白天在不经意间伤到了肩膀从而出现的肩膀疼痛，或者由于夜晚睡眠的姿势不正确，导致落枕，牵扯到肩膀部位，引起疼痛。
睡醒了肩膀疼的原因
1、循环慢又压住了肌肉
人处于睡眠状态的时候，全身的器官和肌肉是处于一个放松，休息的状态，心脏的跳动也会随着睡眠状态变慢，所以，睡着时血液循环是相对是比较慢的。在这种情况下，如果睡姿不对，压着了肩膀，导致肌肉处于用劲儿的状态，也就是僵硬的状态，造成血液运行不通畅，几小时若一直处于这个状态，第二天早上醒来后肩颈处的肌肉自然会麻，会痛。
2、夜里着凉
睡眠状态下免疫系统或者各脏器都处于休息状态，这个时候的防御能力是比较差的，再加上夜里的气温本身会比白天更低，所以很容易着凉，如果肩颈处受了风寒，就容易造成次日起床后出现疼痛，僵硬等不适感。
3、枕头高度不当
睡觉时的枕头高度不当，枕头不要睡得太高，太高会导致你的脖子是弯曲的，早上起床后会产生疼痛感;但是也不可以太低了，低的枕头，会让脖子和肩膀不成一条直线，肩膀很酸痛，甚至会引起落枕。
4、颈背部肌肉痉挛
可包括颈椎骨关节炎、增生性颈椎炎、颈神经根综合征、颈椎间盘脱出症。由于颈椎长期劳损、骨质增生，或椎间盘脱出、韧带增厚，致使颈椎脊髓、神经根或椎动脉受压，进而出现功能障碍。
5、缺钙
如果经常在早上起床之后，会有肩膀脖子酸痛的这种情况发生，那可能就是体内缺钙，骨质疏松和钙质流失也可能导致如此。此外，还可能会有抽筋，脚后跟疼，腰椎疼痛，四肢无力，麻木等等。