百日咳一般需要住院两周左右，因为婴儿患有百日咳，表明婴儿的身体免疫功能较差。百日咳很长一段时间，需要在医生的指导下积极给予正确的抗生素治疗，治疗时间不宜太短，否则病情很容易重复。如果咳嗽严重、喘息或嘴唇发紫，也可以考虑吸氧，这有助于缓解症状。
百日咳治疗方法
1、百日咳确诊后，有必要进行规范的呼吸隔离治疗。百日咳是一种传染病，主要通过空气飞沫呼吸道传播，通过规范的呼吸道隔离。
2、选择正确的抗生素治疗，一般来说百日咳是可以彻底治好的。
婴儿百日咳注意事项
1、为了及时隔离4至6周，最好让孩子一个人住在家里的一个房间或角落里，以防止受到不良刺激。
2、患儿居室应保持空气清新，衣服应经常清洗和保持清洁。发病后，患儿应注意休息，确保睡眠，夜间咳嗽影响睡眠患儿，可酌情给予镇静剂。
3、注意饮食调整，确保每日的热量、液体、维生素等营养物质的供应。尤其是咳嗽和呕吐影响进食的患儿，食物要求干燥、柔软、容易消化。做到少量多餐，随时补充。
4、及时祛痰，防止呼吸困难。可以给一些能稀释痰的药，使痰咳出来，但咳嗽反应重患病较小的小婴儿不宜用药，严重痰涎阻塞，可用吸痰器吸出分泌物。