阴道斜隔是一种并非十分罕见的生殖道畸形，起源于两个宫颈之间的一片两面均附盖阴道上皮的膜状组织与斜向附着于一侧的阴道壁形成一个盲管，把宫颈遮蔽在内，导致隔的后方与宫颈之间有一个腔为“隔后腔”，因此形成了阴道斜隔的状态，接下来将针对阴道斜隔的病因做一个说明。
1、分娩损伤造成
很多患者出现阴道斜隔主要的原因就是在分娩的过程中受到了一定的损伤造成，比如由于胎儿头盆不称、胎位或胎儿异常形成滞产，导致胎先露长时间停留在真骨盆的某一部位不能顺利下降，最后使阴道出现压迫坏死；也有患者在产中不合理地使用缩宫素(催产素)及前列腺素引产等可使阴道壁、宫颈撕裂，甚至子宫破裂，累及泌尿系统形成尿瘘。尿瘘经过补休后再次进行阴道分娩就会因为承受压力过大导致产道撕裂现象，在后期也容易造成阴道斜隔的症状。
2、孕妇科手术损伤造成
女性生殖系统与膀胱、输尿管下段及尿道关系十分密切。若手术者对局部解剖还不是特别熟悉，在处理难产过程中不遵守操作规程，如术前不导尿、粗暴的臀牵引和内倒转、施行产钳和胎头吸引器时未及时发现误夹或误吸阴道宫颈组织等，均可造成软组织损伤，最后造成产妇出现阴道斜隔。近几年来剖腹产的概率非常高，如果患者不加强预防措施，这种阴道损伤也会相应地增加。此外，除了剖腹产手术外，还有一些其他的妇科手术也会造成阴道斜隔，常见的就有子宫颈癌根除术、盆腔子宫内膜异位症手术、全子宫切除术、阴道手术以及妇科内镜手术。所以，在进行妇科手术过程中是否处理得当很重要，能够直接影响到女性群体的身体以及日后的生活，需要引起高度重视。
3、疾病损伤造成
还有部分患者在患有阴道斜隔之前就已经存在子宫托嵌顿、膀胱结石或者膀胱结核等疾病。这些疾病在初期阶段没有经过恰当合理的治疗很容易就会在后期出现一些水肿、充血的症状，久而久之就会破坏阴道组织形成瘘管，进而发展成为阴道斜隔。