其基本功效为开窍醒神、化湿和胃、宁神益志。多用于痰蒙清窍、神志昏迷、湿阻中焦、脘腹痞满、胀闷疼痛、噤口痢、宣通诸窍、焦虑症、抑郁症等。临床常用量为5~10 g。
汤宗明重用石菖蒲治语言謇涩
名老中医汤宗明治疗语言謇涩，甚不能言，用石菖蒲、竹茹、天竺黄宣窍豁痰；若因肾虚精不上承者，加巴戟天、仙茅补肾填精。尤石菖蒲最需重用，用量25~30 g，鲜者更妙。《神农本草经》谓石菖蒲有“开心孔、通九窍、明耳目、出声音”之功。足见用之治失语，恰当不过。
徐景藩重用石菖蒲治久泻
对于泻痢、腹痛者，《日华子本草》谓石菖蒲“除风下气…止心腹痛，霍乱转筋”。《本草备要》云其能“疗噤口毒痢”。国医大师徐景藩教授认为石菖蒲治疗久泻腹鸣，尤为适用。可选参苓白术散、升阳除湿汤、痛泻要方，配用石菖蒲。
久痢则与仙鹤草配用。久泻久痢，大便有赤白黏胨，腹痛隐隐，如慢性结肠炎、慢性细菌性痢疾、溃疡性结肠炎等疾病，宜用本品配伍治疗，也可用石菖蒲20~30 g 加仙鹤草、地榆浓煎保留灌肠。肠功能紊乱，每遇进餐后辄欲大便，大便易溏者，石菖蒲亦有效。