上个世纪80年代以来，中医传统的思维方式和治疗方法就受到了来自各个方面的巨大挑战。西医学的迅速发展逐步影响着、改变着中医界人员的思维方式，形成巨大的冲击，并导致了中医发展的停滞和滑坡。在这种形势下，全国各界，不止是中医界提出了“中医现代化”的口号，旨在促进中医的振兴和发展。这种形势下的中医我们姑且称之为“现代中医”。
有人认为中医学因为未能全方位与现代科学技术紧密结合，发展缓慢，所以至今未能得到长足的发展，主张它应该与现代医学相结合，还应该结合一切现代科学为我所用。初期看来，中医尤其是中药是取得了相当大的发展，但是，我们从实际情况看到，中医研究越来越标准化、客观化，很多学科都从细胞水平、分子水平、基因水平来研究中医中药，结果呢，一味中药越提越纯，临床应用一看，结果却不是这么一回事。事实上，中医现代化已经走入了一个误区。从SARS的爆发和控制过程可以看出，西药所治疗的病人死亡率明显高于中药，而且，中药现代化研究的一些成果在SARS面前仍然束手无策，而我们控制SARS所使用的正是被认为不符合时代发展需要的中药汤剂。
医生指出：“中医现代化，首先要知道几千年来无数的大医和先哲们呕心沥血的成果是什么，只有在这个基础上，才谈得到中医的现代化。”而我们从事中医现代化研究的，有几个真正懂得中医、了解中医?所以中医现代化只能是一种假的现代化，是“伪现代化”。“现在的政策导向是强调用现代科研方法研究中医，其实就是用西医替代中医，美其名曰中医现代化，实际上就是消灭中医”。在这样一种中医现代化的指导思想下，谈中医的创新只能是一句空话。必须牢记的是：只有返本才能创新。事物需要发展，但是如果摒弃原来的基础，只能算是一种新兴事物罢了。中医学只有在自身的准绳内发展，保持自身的特色，中医现代化才能有真正有价值的成果。
中医需要创新，它的现代化应该是继承了五千年传统的现代化，中医一系列独特的理论体系、医学方法，并不是束缚中医发展的绊羁，而是体现中医特色的关键和根本，科学需要突破束缚，但是如果要打破中医这些特征的话，那么现代化的中医也就面目全非了。而中医在几千年来的发展过程中，本身就是在不断的求创新、求发展的，从来就不是抱残守缺、固步自封的，历代中医各家从来都没有停止过对中医学的丰富和发展，重大创新历代层出不穷。
不相信中医独立的学术地位，盲目崇拜西医学方法，对中医自身传统的冷漠，导致中医学术界目前的现状，即：把盲目改造中医传统、简单模仿西医当成中医现代化的方向。中医的发展本身是在一个非常成熟的、完善的、符合客观规律的理论框架之内的，这种发展可以是无限的，如果任意想突破这个框架，必然容易导致违背客观规律。现在的大多数现代化研究只不过是对中医药的量化、标准化、客观化的研究，进行微观的分析，而这种研究成果实际上只不过是对中医药进行一次逻辑语言、数学语言的解释而已，对中医的实际内容没有任何触动，中医药的思维方式仍然没有变化，只是某些形式和外在的东西有所变动，需要注意的是，这些变动可能对中医的发展造成致命的打击。
中医对疾病的认识是通过“黑箱理论”来认识的，控制论认为：认识客观，“黑箱理论”有两种方法，即打开和不打开黑箱。中医认为有诸内必形诸外，我们完全可以不通过打开黑箱的办法研究中医药，而且取得相当大的发展。中医的很多理论是无法通过现代研究来证实的，如阴阳学说、五行学说等，现代研究无法证实它的存在，然而它在实际应用中却证明是行之有效的。中医理论是一种“哲理式”的思辩，实践是一种“经验式”的积累。认识中医必须先从中医的哲学思维入手，中医与西医是截然不同的理论体系，如果一味地从现代科学的角度来研究中医的本质、中医疾病的本质及转归的机制，是行不通的。而且，现代研究也不过是一种思维方式，过分追求中医药的客观化、标准化、量化只能把中医引入死路。尤其是当代的“实验阳性”理论根本改变了中医以人为本的理念，试图用临床--动物实验--临床实验--临床的方法进行中医药的研究，是对中医根本理论方式的漠视。归根结底，中医现代化应该尊重事物发展的客观规律，应先理解中医、理解中医的思维方式才能谈发展。中医几千年来不断的发展、壮大，以至今天获得独立的社会地位，都证明了一个哲学道理：实践是检验真理的唯一标准。
中医学的发展，首先应该是我国古代哲学思想史的发展，然后才是中医学的发展。中医学的各个思维方法都贯穿着我国古代哲学思想，它的不断发展，基本奠定了我国传统医学与哲学两方面的基础。实践证明，它的思想(医学思想、哲学思想)符合当代辨证唯物主义哲学的主要内容。而中医现代化所暴露的问题，又凸显了哲学上的一些基本观点：矛盾论、系统论等。这一系列问题的解决需要建立在对辨证唯物主义哲学的深刻认识上，中医学的发展与哲学的发展是密不可分的，中医现代化不能套用某些模式，只能在不断的摸索和实践中走出一条符合自身发展的、行之有效的思路和方法来。
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