中医理论的两个重要特点是整体观念和辨证施治。这两个特点也体现在气功治疗中。精神与形体同练，以及气功对形体的作用也不是单纯地体现在身体的一个部分、一个内脏、一个系统，而是对全身各系统组织都有影响，这些是我们所熟知的气功对人体的整体作用。在气功整体作用的基础上，也存在某一功法和某一方式练功对某种病变更适应的情况。根据患者体质、病情等因素选择合适的功法或不同练功方式的作法被称为辩证选功。其常用的方法有：
1、根据病情选择不同的练功手段为主的方法：
(1)调息为主的功法：有些病变发生在肺，引起呼吸系统的功能低下，例如矽肺、肺结核、哮喘等。对这些病变，选择以吐呐调息为主要锻炼手段的气功功法，例如吐呐功、六字诀等。
(2)调身为主的功法：有些患者病情不重，但是体质稍差，筋骨肌肉薄弱。对此可选择调身为主的形体功。这类功法多为动功，所谓“外练筋骨皮”即指此而言。此外动功的姿势不断变换还可增加趣味性，尤其对性格活跃、难以静下来的初学者，更宜先学动功。
(3)调神为主的功法：调神功也称为意守功，具有调整神经兴奋性，缓解心理紧张等重要作用。由于这类功法更加强调意念的运用，讲求“意气相随”，被称为“内练一口气”。病变不同，意守的部位也需有所变动。例如一般病变，可意守中丹田;高血压病需意守下丹田或脚心。而脱肛、慢性肠炎、胃下垂等中医诊为中气下陷的病变，需要意守上丹田。
2、根据体质病情选择不同体势功法：
(1)病重体虚者：可选择卧位静功
(2)体弱患者：可选择半卧位、靠坐位、或坐位的静功。
(3)病轻体壮者：可选择站桩，或行走功法。
3、根据气质性格差别选择静、动功法：
(1)对于青年人，尤其是思想活跃，注意力不易集中，难以入静的人，可先选择动功锻炼，待注意力能容易地集中到各种动作所要求的意念中后，再过渡到静功锻炼上。
(2)对于思想沉静、注意力易于集中的人，可先选择静功，待很快达到入静状态后，再过渡到动功锻炼上来。
4、根据四时季节所主内脏选择功法：
春季多练调肝的功法，夏季多练调心的功法，夏秋之交多练调脾的功法，秋季多练调肺的功法，冬季多练调肾的功法。
5、根据五脏配五行的关系选择功法：
五禽戏、六字诀等功法的每一节都与一个脏腑相连，可根据不同脏腑病变选择相应的节段功法加强锻炼。
6、根据子午流注理论选择功法：
子午流注中的每一时辰都与一个脏腑相连，可根据病变脏腑的主时，在相应时辰里加强练功。
辨证练气功是相对的灵活的，可依一种方法来选功，也可依多种方法结合来选功。要取得良好的效果，在辨证选择气功的基础上，更要理解和掌握好练气功要领。
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