2009年7月20日，山东省本科二批二志愿投档，共投出9667人，其中文科2806人、理科6861人。二志愿投出后，尚有71所（2008年是96所）文科院校的1824个计划、79所（2008年是138所）理科院校的2329个计划等待调剂。
二志愿投档原则，仍旧是按1：1的比例将二志愿生源投入一志愿生源不满额的院校。考生投入二志愿院校后，只要填报了“专业服从调剂”，一般不会被招生院校退档。
2009年的本科二批计划91000多人，二志愿投出后，仅剩4153人等待调剂，占计划人数的约4.5%。一、二志愿的命中率在历年中居高。由此可见，考试填报志愿时的心理逐年成熟，理性的成分逐渐增多，同时，各级招考部门的工作人员以及中学教师对我省招生、考试政策的宣传是到位的，在指导考生填报志愿时是认真、负责的。
从二志愿投出后的缺额看，很多院校缺额并不是很多，生源缺的多的院校大部分还是师范院校和医学院校以及地域有些偏远的地方院校。
二志愿文科分602分投入安徽财经大学；637分的理科进入山东政法学院。
7月22日－23日，本科二批二志愿将进行调剂。