复旦学院于2005年9月成立，是学校全面系统实施通识教育的学术研究和管理机构。学院汲取国内外一流大学本科生培养的经验，始终坚持以培养全面发展的高素质、创新型人才为目标，全面推进本科教育教学体制的改革，目前负责全校本科一年级和部分两年级学生的教育教学管理工作。
【通识教育核心课程】
复旦学院着力推进通识教育核心课程建设，力求突破单纯的“专业视域”和单纯的“知识视域”，从培养新时代中华民族的一代新人的角度出发，为学生提供能够帮助其形成基本的人文修养、思想视野和精神感悟的课程。
通识教育核心课程体系包括6大模块：
◆文史经典与文化传承
◆哲学智慧与批判性思维
◆文明对话与世界视野
◆科技进步与科学精神
◆生态环境与生命关怀
◆艺术创作与审美体验
【书院式学生管理】
借鉴国外一流大学住宿学院模式，承续中国书院和复旦大学历史文化传统，复旦学院构建了与教学改革相适应的全新的书院式学生管理体制。学院以马相伯、李登辉、颜福庆和陈望道4位复旦历德高望重的老校长的名或字命名，建设志德、腾飞、克卿和任重4个书院。
◆书院根据专业、国别地域、民族分散的原则编班和安排宿舍，鼓励不同背景的学生互相学习交流，希望对学生性格养成、学术兴趣、价值取向等产生积极的影响。
◆各书院宿舍楼内设校长像、校长事迹陈列室，希望复旦先贤们的光辉人生历程、坚定理想信念和高尚精神气质成为每一个学生学习奋进的榜样。
◆各书院宿舍楼内建设“学而时习斋”，设学习讨论室、导师咨询室、经典著作阅览室、信息网络室等，为广大学生的课外学习、实践创造良好的氛围和条件。
志德书院系纪念复旦创始人马相伯先生。先生名“志德”，字相伯，取其意，明志且道德高尚。马相伯校长毕生致力于中国教育事业，是中国近代的爱国主义者和民主主义者，是中国现代教育高瞻远瞩、筚路蓝缕的先哲。
志德书院以绿色为标志性颜色，门匾字体为秦篆，秦篆是我国古代汉字统一的标志。书院楹联取自江西友教书院，“志于道据于德依于仁，而后游于艺；修其身齐其家治其国，必先正其心。”
“志德讲会”、“每月7日书院日”、“志德学子高中行”等是书院特色文化活动品牌。
腾飞书院系纪念复旦老校长李登辉先生。先生字腾飞，取其意，崛起成功。李登辉校长毕业于耶鲁大学，1913年至1936年任校长，很早就提出培养完善人格的教育理念，是复旦精神的奠基者。
腾飞书院以红色为标志性颜色，门匾字体为汉隶，汉隶的形成极大提高了书写的速度，从而加速了文化传播。书院楹联取自安徽怀古书院，“乾始坤承，通彻古今上下，总是鸢飞鱼跃；静虚动直，浑忘物我内外，无非月满潮平。”
“腾飞论坛”、“腾飞定向”、“每月18日书院日”等是书院特色文化活动品牌。
克卿书院系纪念上海医学院创办者颜福庆先生。先生字克卿。颜福庆校长不仅创办了医学院，更将“不计功利，为社会、为人群服务”的理念在实践中发扬光大。
克卿书院以蓝色为标志性颜色，门匾字体为魏碑，魏碑是南北朝时期碑志、雕刻使用的字体，用以树碑立传纪念先贤的尊贵品格。书院楹联取自安徽金鹗书院，“读书面对圣贤，当知所学何事；立志胸存社稷，但求无愧于心。”
“克卿人节”、书院刊《新卿年》等是书院特色文化活动品牌。
任重书院系纪念解放后第一任校长陈望道先生。先生字任重，取其意，任重而道远。陈望道校长是《共产党宣言》中译本第一任翻译者，也是修辞学的一代宗师。
任重书院以橙色为标志性颜色，门匾字体为唐楷，唐楷的出现代表文字从古代演变到了现代。书院楹联取自江西凝秀书院，“力学如为山九仞，高须加一篑；行仁若法海十分，满尚纳千流。”
“任重沙龙”、书院歌《任重学子志》等是书院特色文化活动品牌。
【全方位学业指导】
复旦学院发动全校教育资源，建立了导师团，承担指导学生日常学习、课程修读、具体选课和大学学习生活规划的重要任务。
导师团由专职导师、特邀导师和兼职导师组成。专职导师根据学生作息时间为学生提供个性化学业指导；特邀导师以讲座座谈方式指引学生学养拓展和人生导航；各院系教授学者以班级兼职导师身份深入班级寝室，与学生亲密接触、充分交流。
【通识综合教育计划】
复旦学院在学生课余生活中积极推动、深入开展“通识综合教育”系列计划。
“大学导航计划”
帮助学生熟悉并融入校园生活、认识各院系专业内涵，规划大学生活和未来人生旅程。
◆大学导航系列讲座
◆大学导航系列手册
◆专业院系学科学术文化系列周
“学养拓展计划”
引导学生接触学术大师，走近文化经典，贴近学科前沿，拓宽学术视野，提升人生境界。
◆“伟大的经典”读书活动
·经典著作读书小组
·书评交流和竞赛
◆学养拓展系列讲座
“知识补习计划”
帮助学生掌握形成良好的学习方法和习惯，增强学习动力，树立自信，全面发展。
◆英语、计算机和汉语零起点辅导班
◆学科、课程学习互助小组
◆导师专题咨询会
“公民教养计划”
引导学生了解市情和国情，促进身心和谐健康，培养集体荣誉感，明晰社会责任，树立人生理想，成为全面发展的高素质公民。
◆礼仪教育
◆“红色之旅·革命史迹寻访”活动
◆“介绍我的家乡”主题班会
◆“感恩关怀”主题活动
◆健心房和“心灵成长电影周”
◆各类社会实践和志愿者活动