长期发烧查不到原因，往往病因较为复杂，可能与以下因素有关：一是感染性疾病，可以通过血检、查病原微生物、尿培养、痰培养、血培养来检查致病原。二是肿瘤性发热，需要检查原发肿瘤病灶。三是自身免疫性疾病导致的发热，自身的抗体攻击自身的细胞导致全身出现自身免疫性的疾病，也会导致发热现象的发生。四是其它不明原因引起的发热，象神经性的，还有医学不发达，不能够明确病因的发热。
长期发热查不到原因怎么办
1、长期发烧，重点是要检查风湿类疾病、肿瘤和血液类疾病。在临床上，很多长期发烧患者与风湿性疾病有关系。肿瘤患者与血液病患者的发烧来自两方面，一方面是病灶本身的发热，另一方面会引起炎症发烧。查明病因有针对性的进行治疗。
2、检查结核病的可能。结核可以在身体的很多部位，症状往往不明显，但会引起反复发热，在临床上往往容易重视不够，导致误诊。可以用抗结核药物进行治疗。
3、检查慢性感染疾病。慢性的肠胃炎、咽炎等其它炎症也会引起低烧，身体内有一些微生物，也可能会引起发烧。可以用消炎药物进行治疗。
4、检查植物神经功能紊乱。这个往往会低烧，并伴有五心烦热，通常是调节身体体温的神经中枢发育异常导致的。通常用营养神经的药物来治疗，也可以多吃新鲜的水果和蔬菜来调节。